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[감염병연구]

코로나암 환자 의료 및 단백체 데이터

코로나암 환자 및 단백체 데이터

  • 등록일2023-11-17
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  • 카테고리감염병연구
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2023-11-17 2023-12-06 무기한 셀키
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● 데이터 상품명 코로나암 환자 의료 및 단백체 데이터 ● 데이터 상품 부제 코로나암 특화 임상 및 단백체 데이터와 의료데이터 ● 데이터 상품 요약 미국 국립암연구소 (NCI)의 코로나암 의료 및 단백체 정성·정량 분석 결과 ● 데이터 상품 정보 ■ 상품 설명 및 특징 - 국내 최초·최대 암 관련 (관련 질병 포함) 당·단백질 질량분석 실험 데이터의 해석 및 당·단백질 리포지토리를 구축하고 정밀의료 연구기술에 발전시키고자 함 - 위암 환자 시료를 전처리하여 고분해능 질량분석기기를 통해 최적화된 분석을 진행하고 당사에서 자체 개발한 분석솔루션 SpAC9 Pipeline을 활용하여 데이터분석 등의 프로세스를 통하여 표준화 기준에 맞춰 최종 데이터를 가공, 생산함 - NCI 의 CPTAC에서 제공된 질량분석이 완료된 코로나암 RAW 데이터는 SpAC9 Pipeline을 활용하여 재분석하고 표준화 기준에 맞춰 데이터를 가공·생산함 ■ 기간 및 범위 - 2023년 9월 ~ 2023년 10월 ■ 컬럼(속성) 정보 - 집계시작년월 : 2023년 9월 - 집계시작년월 : 2023년 10월 ■ 약어/전문용어 설명 - NCI: National Cancer Institute - CPTAC: Clinical Proteome Tumor Analysis Consortium ■ 활용 예제 - 시스템 확대·발전 - 의료 및 단백체 빅데이터 고도화를 위한 유전단백체 변이 아틀라스 구축으로 시스템 확대 및 발전 - 인간의 유전단백체 변이 아틀라스를 구축하여 질병 별로 유전자 변이가 단백질의 변이를 일으키는 경우의 데이터베이스 구축하여 질병의 이해와 개인 맞춤형 신약 개발 및 진단 발굴 사업에 필요한 데이터를 제공

샘플정보
그룹명
결과파일명
결과ID
질량분석기기분석일자
생성일자
수정일자
ID
환자번호
샘플번호
암코드
튜브유형
정보수집시간
연령대
나이
사망상태
유전자심볼
단백질심볼
단백질명
펩타이드명
펩타이드질량
펩타이드전하
펩타이드스캔1ID
펩타이드스캔2ID
펩타이드값
펩타이드함량
GN03 COVI_Proteome 20231120 87 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 56 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 4
GN01 COVI_Proteome 20231120 9 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 7
GN02 COVI_Proteome 20231120 48 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 7
GN01 COVI_Proteome 20231120 1 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 11
GN01 COVI_Proteome 20231120 2 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 11
GN01 COVI_Proteome 20231120 3 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 4
GN01 COVI_Proteome 20231120 4 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 5
GN01 COVI_Proteome 20231120 5 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 7
GN01 COVI_Proteome 20231120 6 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 12
GN01 COVI_Proteome 20231120 7 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 7
GN01 COVI_Proteome 20231120 8 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 10
GN01 COVI_Proteome 20231120 10 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived TIMP2 P16035 Metalloproteinase inhibitor 2 EYLIAGK 2
GN01 COVI_Proteome 20231120 11 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived PARK7 Q99497 Protein_deglycase_DJ-1 ALVILAK 0
GN01 COVI_Proteome 20231120 12 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived RBP4 P02753 Retinol-binding protein 4 YWGVASFLQK 9
GN01 COVI_Proteome 20231120 13 16184 21 COVI ACD 0 70-79 71 Survived GC P02774 Vitamin D-binding protein VLEPTLK 12
GN01 COVI_Proteome 20231120 14 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 11
GN01 COVI_Proteome 20231120 15 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 10
GN01 COVI_Proteome 20231120 16 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 3
GN01 COVI_Proteome 20231120 17 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 5
GN01 COVI_Proteome 20231120 18 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 6
GN01 COVI_Proteome 20231120 19 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 11
GN01 COVI_Proteome 20231120 20 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 7
GN01 COVI_Proteome 20231120 21 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 9
GN01 COVI_Proteome 20231120 22 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 6
GN01 COVI_Proteome 20231120 23 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived TIMP2 P16035 Metalloproteinase inhibitor 2 EYLIAGK 3
GN01 COVI_Proteome 20231120 24 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived PARK7 Q99497 Protein_deglycase_DJ-1 ALVILAK 1
GN01 COVI_Proteome 20231120 25 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived RBP4 P02753 Retinol-binding protein 4 YWGVASFLQK 9
GN01 COVI_Proteome 20231120 26 16184 109 COVI ACD 2 70-79 71 Survived GC P02774 Vitamin D-binding protein VLEPTLK 12
GN01 COVI_Proteome 20231120 27 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 12
GN01 COVI_Proteome 20231120 28 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 11
GN01 COVI_Proteome 20231120 29 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 3
GN01 COVI_Proteome 20231120 30 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 5
GN01 COVI_Proteome 20231120 31 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 6
GN01 COVI_Proteome 20231120 32 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 9
GN01 COVI_Proteome 20231120 33 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 7
GN01 COVI_Proteome 20231120 34 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 8
GN01 COVI_Proteome 20231120 35 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 6
GN01 COVI_Proteome 20231120 36 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived TIMP2 P16035 Metalloproteinase inhibitor 2 EYLIAGK 2
GN01 COVI_Proteome 20231120 37 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived PARK7 Q99497 Protein_deglycase_DJ-1 ALVILAK 1
GN01 COVI_Proteome 20231120 38 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived RBP4 P02753 Retinol-binding protein 4 YWGVASFLQK 10
GN01 COVI_Proteome 20231120 39 16184 114 COVI ACD 7 70-79 71 Survived GC P02774 Vitamin D-binding protein VLEPTLK 12
GN02 COVI_Proteome 20231120 40 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 9
GN02 COVI_Proteome 20231120 41 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 42 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 9
GN02 COVI_Proteome 20231120 43 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 5
GN02 COVI_Proteome 20231120 44 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 7
GN02 COVI_Proteome 20231120 45 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 12
GN02 COVI_Proteome 20231120 46 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 47 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 9
GN02 COVI_Proteome 20231120 49 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived TIMP2 P16035 Metalloproteinase inhibitor 2 EYLIAGK 2
GN02 COVI_Proteome 20231120 50 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived PARK7 Q99497 Protein_deglycase_DJ-1 ALVILAK 3
GN02 COVI_Proteome 20231120 51 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived RBP4 P02753 Retinol-binding protein 4 YWGVASFLQK 9
GN02 COVI_Proteome 20231120 52 16597 2 COVI ACD 0 56-69 60 Survived GC P02774 Vitamin D-binding protein VLEPTLK 11
GN02 COVI_Proteome 20231120 53 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 10
GN02 COVI_Proteome 20231120 54 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 10
GN02 COVI_Proteome 20231120 55 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 4
GN02 COVI_Proteome 20231120 57 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 7
GN02 COVI_Proteome 20231120 58 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 12
GN02 COVI_Proteome 20231120 59 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 60 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 61 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 6
GN02 COVI_Proteome 20231120 62 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived TIMP2 P16035 Metalloproteinase inhibitor 2 EYLIAGK 0
GN02 COVI_Proteome 20231120 63 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived PARK7 Q99497 Protein_deglycase_DJ-1 ALVILAK 1
GN02 COVI_Proteome 20231120 64 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived RBP4 P02753 Retinol-binding protein 4 YWGVASFLQK 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 65 16597 62 COVI ACD 2 56-69 60 Survived GC P02774 Vitamin D-binding protein VLEPTLK 11
GN02 COVI_Proteome 20231120 66 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 12
GN02 COVI_Proteome 20231120 67 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 11
GN02 COVI_Proteome 20231120 68 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 5
GN02 COVI_Proteome 20231120 69 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 5
GN02 COVI_Proteome 20231120 70 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 7
GN02 COVI_Proteome 20231120 71 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 7
GN02 COVI_Proteome 20231120 72 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 73 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 8
GN02 COVI_Proteome 20231120 74 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 6
GN02 COVI_Proteome 20231120 75 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived TIMP2 P16035 Metalloproteinase inhibitor 2 EYLIAGK 1
GN02 COVI_Proteome 20231120 76 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived PARK7 Q99497 Protein_deglycase_DJ-1 ALVILAK 2
GN02 COVI_Proteome 20231120 77 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived RBP4 P02753 Retinol-binding protein 4 YWGVASFLQK 10
GN02 COVI_Proteome 20231120 78 16597 49 COVI ACD 7 56-69 60 Survived GC P02774 Vitamin D-binding protein VLEPTLK 11
GN03 COVI_Proteome 20231120 79 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 12
GN03 COVI_Proteome 20231120 80 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 11
GN03 COVI_Proteome 20231120 81 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 7
GN03 COVI_Proteome 20231120 82 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 5
GN03 COVI_Proteome 20231120 83 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 7
GN03 COVI_Proteome 20231120 84 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 11
GN03 COVI_Proteome 20231120 85 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 7
GN03 COVI_Proteome 20231120 86 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 9
GN03 COVI_Proteome 20231120 88 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived TIMP2 P16035 Metalloproteinase inhibitor 2 EYLIAGK 2
GN03 COVI_Proteome 20231120 89 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived PARK7 Q99497 Protein_deglycase_DJ-1 ALVILAK 1
GN03 COVI_Proteome 20231120 90 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived RBP4 P02753 Retinol-binding protein 4 YWGVASFLQK 9
GN03 COVI_Proteome 20231120 91 16918 44 COVI ACD 0 80+ 82 Survived GC P02774 Vitamin D-binding protein VLEPTLK 12
GN03 COVI_Proteome 20231120 92 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived APOC1 P02654 Apolipoprotein C-I EWFSETFQK 12
GN03 COVI_Proteome 20231120 93 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived APOC2 P02655 Apolipoprotein C-II TYLPAVDEK 11
GN03 COVI_Proteome 20231120 94 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived CA1 P00915 Carbonic anhydrase 1 VLDALQAIK 4
GN03 COVI_Proteome 20231120 95 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived CD5L O43866 CD5 antigen-like LVGGLHR 5
GN03 COVI_Proteome 20231120 96 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived C1QB P02746 Complement C1q subcomponent subunit B IAFSATR 7
GN03 COVI_Proteome 20231120 97 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived CRP P02741 C-reactive protein AFVFPK 12
GN03 COVI_Proteome 20231120 98 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived GPX3 P22352 Glutathione peroxidase 3 QEPGENSEILPTLK 7
GN03 COVI_Proteome 20231120 99 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived IGKV4-1 P06312 Immunoglobulin kappa variable 4-1 NYLAWYQQKPGQPPK 9
GN03 COVI_Proteome 20231120 100 16918 56 COVI ACD 2 80+ 82 Survived LYZ P61626 Lysozyme C AWVAWR 8
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